Granicero presenta las historias de Noé y Timoteo, dos habitantes de Texcoco, quienes lograron salir ilesos después de recibir la descarga eléctrica de un rayo. Sin embargo, sus vidas toman un giro inesperado cuando comienzan a experimentar sueños y reciben mensajes que no logran comprender.

El documental explica el significado de Granicero, un ser especial, que al ser tocado por un rayo recibe una serie de poderes para controlar las lluvias para las actividades agricultura. Así pues, estos personajes son elegidos por el Dios Tláloc como intermediarios entre el cielo y la tierra, pero en caso de no cumplir con la encomienda, estarán condenados.